Zbirka Austrougarskog perioda broji oko 4.000 predmeta. Opšti dio zbirke sadrži muzejski materijal većim dijelom strane – zapadne, a manjim dijelom domaće provenijencije. Tu su takođe vladini pečati, vojne mape, stenogrami sa sjednica Sabora, projekti nekih sarajevskih objekata, fotografije itd…

U ovu zbirku spadaju i zaostavštine poznatih sarajevskih porodica: Despić, Skarić, Besarović, Škaljić i Jeftanović. Takođe sadrži i znatan broj knjiga, časopisa i štampe na njemačkom i našem jeziku, a odnose se na Sarajevo i BiH.
Etnografski dio zbirke čine odjevni predmeti i oružje koji su pripadali austrijskim činovnicima, zatim “austrijska soba” u stilu bidermajer, servisi iz “Konaka”, Karadžozovo pozorište lutaka itd… Značajan dio zbirke predstavlja i kolekcija posvećena pokretu “Mlada Bosna”, koja je izvršila sarajevski antentat.
Pored ovih kolekcija koje su od neprocjenjive dokumentarne vrijednosti, zbirka sadrži arhivski, fotografski, etnografski i dokumentacioni materijal o okupaciji, aneksiji, vojnim manevrima, posjete carskog para Sofije i Ferdinanda Sarajevu, izvršenju atentata itd…